Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SSPNQ14714 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 273.4 ms