Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TNFAIP1Q13829 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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