Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GRIK3Q13003 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GRIK3Q13003 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
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