Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
CENPEQ02224 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.83□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-1.84□□□□□ -2.7
CENPEQ02224 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
CENPEQ02224 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241 ms