Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SKIDA1Q1XH10 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.5 ms