Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
SGCAQ16586 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SGCAQ16586 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
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