Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CNN3Q15417 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CNN3Q15417 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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