Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PTPRTO14522 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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