Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SEC23BQ15437 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SEC23BQ15437 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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SEC23BQ15437 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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SEC23BQ15437 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SEC23BQ15437 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SEC23BQ15437 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SEC23BQ15437 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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SEC23BQ15437 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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SEC23BQ15437 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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SEC23BQ15437 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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SEC23BQ15437 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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SEC23BQ15437 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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SEC23BQ15437 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SEC23BQ15437 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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