Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
GRIK3Q13003 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK3Q13003 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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