Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NPRL3Q12980 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPRL3Q12980 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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