Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
PTPRTO14522 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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PTPRTO14522 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PTPRTO14522 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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