Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRAPPC13A5PLN9 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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