Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ZIC1Q15915 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
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