Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CNGB1Q14028 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CNGB1Q14028 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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