Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
DDX39BQ13838 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
DDX39BQ13838 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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