Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PDE3BQ13370 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PDE3BQ13370 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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