Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZIC1Q15915 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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