Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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FOXD4Q12950 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
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FOXD4Q12950 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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FOXD4Q12950 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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FOXD4Q12950 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
FOXD4Q12950 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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