Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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PTPRAP18433 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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PTPRAP18433 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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PTPRAP18433 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPRAP18433 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPRAP18433 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRAP18433 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPRAP18433 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
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PTPRAP18433 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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PTPRAP18433 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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PTPRAP18433 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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PTPRAP18433 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PTPRAP18433 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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PTPRAP18433 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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PTPRAP18433 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
PTPRAP18433 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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