Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
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TRIM63Q969Q1 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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TRIM63Q969Q1 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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TRIM63Q969Q1 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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TRIM63Q969Q1 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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TRIM63Q969Q1 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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TRIM63Q969Q1 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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TRIM63Q969Q1 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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TRIM63Q969Q1 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRIM63Q969Q1 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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