Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNN3Q15417 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNN3Q15417 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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