Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SQSTM1Q13501 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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