Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
TRIM63Q969Q1 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
TRIM63Q969Q1 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.1 ms