Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PDE3BQ13370 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PDE3BQ13370 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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