Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK3Q13003 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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