Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CNGB1Q14028 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CNGB1Q14028 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.5 ms