Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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DDX39BQ13838 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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DDX39BQ13838 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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DDX39BQ13838 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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DDX39BQ13838 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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DDX39BQ13838 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DDX39BQ13838 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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