Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SNX13Q9Y5W8 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX13Q9Y5W8 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
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