Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TRIM63Q969Q1 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms