Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
SSPNQ14714 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
SSPNQ14714 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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