Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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DDX39BQ13838 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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DDX39BQ13838 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
DDX39BQ13838 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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