Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PDE3BQ13370 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PDE3BQ13370 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 436.9 ms