Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD4Q12950 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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FOXD4Q12950 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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FOXD4Q12950 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD4Q12950 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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