Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ARID3CA6NKF2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ARID3CA6NKF2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms