Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CNN3Q15417 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CNN3Q15417 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CNN3Q15417 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CNN3Q15417 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CNN3Q15417 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CNN3Q15417 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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CNN3Q15417 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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CNN3Q15417 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CNN3Q15417 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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