Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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