Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZIC1Q15915 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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