Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQSTM1Q13501 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SQSTM1Q13501 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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