Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC4□□□□□ -1.77
PDE3BQ13370 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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