Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
TRIM63Q969Q1 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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TRIM63Q969Q1 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TRIM63Q969Q1 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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