Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE3BQ13370 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE3BQ13370 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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