Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
PTPN13Q12923 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPN13Q12923 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
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