Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PTPRTO14522 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.1 ms