Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
DDX39BQ13838 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
DDX39BQ13838 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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