Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
PTPRTO14522 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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