Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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