Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
RDH8Q9NYR8 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RDH8Q9NYR8 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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