Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KLF9Q13886 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KLF9Q13886 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KLF9Q13886 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.59□□□□□ -2
KLF9Q13886 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
KLF9Q13886 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 301.5 ms