Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SQSTM1Q13501 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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SQSTM1Q13501 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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SQSTM1Q13501 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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SQSTM1Q13501 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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SQSTM1Q13501 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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SQSTM1Q13501 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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SQSTM1Q13501 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SQSTM1Q13501 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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